Simone
一开始的时候画面是在东京都,高木和佐藤在追抢劫犯,在你追我赶之后,犯人终于被逮到,这时犯人说出了海盗旗三个字.画面转到了神海岛.毛利小五郎因为抽中了30万日元的奖金,原本想一个人去巴黎玩.但是最后变得带了兰,园子,柯南,阿笠博士,步美,元太,灰原哀,光彦,一行人来到了这个小岛. 这个小岛有沉入海底的古代遗迹海底宫殿和300年前确实存在的Anne Bonny（记不得拼写了……）和Mary Read两个女海贼遗留下来的宝藏的传说。在两个月前有流言说宝藏被找到，引来了大批的游客和找宝藏的人，毛利也因此没能在酒店定到房间，他们一行人被当地的观光课课长岩永带到了经营民宿美马的家。 少年侦探团们去参观了当地的博物馆，在博物馆有两件非常珍贵的物品，一把刀和一把枪，据说是那两个女海贼的武器。少年侦探团在岩永的建议下去玩寻宝藏的游戏。 另一边兰和园子去潜水，想去看海底宫殿。他们在负责他们这次海底之旅的店中碰到了三个寻宝人，分别是田山，松本，伊豆。当兰，园子，和当地的导游三人潜入海底的时候看到田山被鲨鱼围攻，松本，伊豆虽然极力保护，但是田山还是没能被救活。高伍 柯南觉得事情不对，就去调查，发现田山的潜水衣下面有塑料袋的痕迹，是有人故意将鱼血放在塑料袋里，随着潜的越深，压力变得越大，塑料袋破裂，血的气味引来了鲨鱼群。这次的事件使木暮警官，白鸟，佐藤，高木都来到了这个海岛，通过指纹发现松本是世界上有名的寻宝人，而且身上有很多案子。海底有宝藏的传言真实性变得越来越高。 少年侦探团们的寻宝游戏还在继续中，博物馆传来两件物品被盗，那两个女海贼的枪和刀。柯南在寻宝的途中看见那两个寻宝人在偷盗物品后遭枪击。 第二天兰和园子再次想去海上玩，却被那两个寻宝人当成人质。台风来临，少年侦探团们的寻宝游戏中的暗号也终于都被解开，柯南发现民宿的主人也是一个寻宝人，在他的帮助下发现少年侦探团们手里拿的那张地图其实是真正的寻宝图，宝藏应该在离海神岛不远的赖亲岛的附近，只是因为地震的关系，进口被堵住了，只能通过海底走。这时有人来通报说兰和园子被当成了人质，去了赖亲岛柯南在美马的帮助下也去了赖亲岛，去救兰。 园子的胳膊被刻意的划伤，为的是帮那两个寻宝人引开鲛，园子陷入鲨鱼群，兰拼命救园子，终于顺利的逃离，进入海底宫殿的内部。毛利知道女儿的情况后拼命想去救助，但是台风越来越厉害，他们只能等待。辩核 松本，伊豆，兰，园子终于找到了女海贼所藏的海贼船，但是却没有宝藏，松本和伊豆想杀人灭口，在千钧一发之际，柯南赶到，岩永跟随柯南也携念掘来到了海底宫殿，所有的谜题也都揭开。 此时地震发生，海底宫殿就要倒塌，柯南利用甲烷引起爆炸，打破了宫殿的顶部，让海盗船浮出水面。台风过去，毛利一行人在海上等待，海盗船浮出，可1分钟后海盗船就因为年代太久，解体了。最后小兰和柯南顺利获救。
