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红皇后假说（The Red Queen hypothesis），是美国芝加哥大学进化生物学家利·范·瓦伦（L. van Valen）于1973年提出的生态学假说。
红皇后假说内容为，在环境条件稳定时，一个物种的任何进化改进可能构成对其他物种的竞争压力，即使物理环境不变，种间关系也可能推动生物进化。
红皇后假说与物种选择说结合起来，可以解释具有进化功能的遗传结构起源。其强调了物种生存环境中的生物学因素，但忽略了物理环境因素，故红皇后假说尚需进一步验证。
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