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中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所成立于1949年，是中国疾病预防控制中心下属的独立法人机构，是中国国家级病毒性疾病的预防控制和医学病毒学研究机构。
病毒病所主要职能为拟订与病毒病预防控制相关的法律、法规、规章、政策、标准、规范、预案及规划等提供科学依据，开展防制策略和控制措施的研究；为政府病毒病预防与控制决策提供及时、准确、科学、全面的病毒病监测与流行资料等技术支持和参考意见；为地方病毒病控制与预防提供指导意见和科学技术服务；对重大疫情进行现场监控与处理；对计划免疫中病毒疫苗使用效果进行评价；从事国际合作,联防世界范围的病毒性传染病；建立完善的病毒病监测网络，对全国病毒病流行情况进行监测、信息收集、处理上报和专项分析；建立完善的病毒检测与参比实验室系统，对病毒进行分离检定；促进病毒诊断、疫苗和治疗等病毒生物技术发展，为病毒病预防与控制提供新技术、新方法；加强疾病预防控制医学人才的培养。
根据2020年8月官网显示，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所设有18个专业科室、2个专业管理科室、2个专业学术杂志编辑部和12个职能机构；拥有院士4名，首席专家1名。
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