Simone
通用的，没什么区别。
推荐写作“启航”。“起航”是异形词，不推荐使用（可以参考国家发布的异形词整理表）。
另外，首次航行叫“首航”。
启航和起航，没有什么区别，可以通用。用于车、船、飞机开始上路意思，二者可以互用。
例如：
[启程]起程，上路；360问答---见《现代汉语词典》889页
[启运]起运，；---见《现代汉语词典》889页
[起另几办曲城频程]上路，行程开始；；---见《现代汉语词典》891页
[起航]轮船出发，；---见《现代汉语词典》891页
但是，有的地方不通用：
例如；
[起跑][起步]，不能写为：启跑，启步。
