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中国科学院直属高等学校是根据《国务院关于进一步调整国务院部门（单位）所属学校管理体制和布局结构的决定》（国发〔1999〕26号），由中国科学院继续管理的高等学校。
中国科学院直属普通高等学校有2所：中国科学技术大学（The University of Science and Technology of China，简称中国科大、USTC）、中国科学院大学（University of Chinese Academy of Sciences，简称国科大、UCAS）。
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