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藏品展区上海科技馆以收集华东地区乃至中国地区的自然界和人类遗物为上海科技馆上海科技馆目标。通过保存这些自然界及人类遗物，前拍滚利用收藏品进行学术研究，增进人们对自然界及其演化史的了解，并透过展示及解说，传播收藏品所代表的教育意义。藏品区现收藏藏品约25万件，隶属植物、动物、古生物地质及人类五大类。植物又可分为种子植物类、蕨类、苔藓类、藻类、地衣类、菌类等六类，动物可分为哺乳类、鸟类、爬行类、两栖类、鱼类、无脊椎动物、昆虫；人类分人类体质学与民俗人类学。其中，植物标本数量约15万件，哺乳动物标本3186件，鱼类标本9456件，鸟类标本9407件，两栖爬行类标本8524件，无脊椎标本44555件，昆虫标本为27880件，地质标本4807件，古生物6676件，人类民俗标本862件，古尸16件。在上海科技馆收藏的诸多门类中，动物以两栖爬贺游行类最具特色，两栖类收藏占全国46.6%，爬行类占全国的56.3% ；植物以高等植物和地衣比较完整，古生物的以山旺化石群标本、上海地区全新世脊椎动物亚化石标本和分别来自山东临朐的哺乳动物化石标本和辽西鸟类标慧余本最有特色。
