Simone
已经有个非常详细专业的回答，但好像是从非常物理或者非常化学的角度的回答。
我想提从药物设计的角度，简单提一下形成氢键的有距离和角度要求，和氢键在药物与蛋白结合中的作用。
距离 在药物设计领域，药物和靶点蛋白的互相作用中也涉及氢键。我看有个回答提到了0.25nm 之内可以形成强的氢键。 而通过分析众多已知的药物和蛋白靶点的晶体，大家基本上有个共识，那就是在0.5 nm 或者 5 Å, 以内都有可能形成氢键。
角度 一般认为小于120 度的取位就难以形成氢键，所以氢键基本上看起来是一条直线。但是，如果通过水分子介导，原本直接难以形成氢键的两个原子也可以形成氢键网络。
虽然距离越远，氢键越弱，但弱氢键可能对药物分子的选择性结合有重要意义。
药品与蛋白之间的氢键 几乎所有的小分子激酶抑制剂，比如 我不是药神里的那个药 ，都与激酶的一个特定氨基酸形成了至少一个相对 较强的氢键 ，这个氢键是药品与蛋白靶点结合的推动力或者亲和力之一。 而药品的其他位置则可能形成 弱氢键 或者疏水作用，可能是药品选择性结合其靶点蛋白，因而可阻断特定信号通路，从而达到治疗特定疾病的效果。
